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Durante o Conselho Europeu de 25 de março de 2004, na sequência de uma proposta apresentada pelo secretário-geral do Conselho e Alto Representante para a PESC (Javier Solana), foi nomeado um coordenador da luta contra o terrorismo. Tendo sido designado para este cargo, com um mandato de três anos, o holandês Gijs de Vries, antigo Secretário de Estado holandês para os Assuntos Internos e representante do seu governo na Convenção Europeia.
A criação de um coordenador da União Europeia na luta antiterrorista, também designado na gíria comunitária como o "Sr. Terrorismo”, surgiu no rescaldo dos ataques terroristas de 11 de março de 2004, em Madrid.
O Programa de Estocolmo (dezembro de 2009) veio reafirmar a importância do papel do Coordenador da Luta contra o Terrorismo em assegurar a implementação e avaliação da Estratégia Europeia de Luta Contra o Terrorismo. As suas principais funções consistem na coordenação do trabalho do Conselho da UE na luta contra o terrorismo, em manter uma visão geral de todos os instrumentos que a União tem ao seu dispor nesta área, em acompanhar a implementação da Estratégia da União na luta contra o terrorismo nos vários Estados Membros e em garantir a visibilidade das políticas da União no âmbito da luta contra o terrorismo, promovendo uma melhor comunicação entre a UE e países terceiros.
A ação desenvolvida pela União Europeia no combate ao terrorismo tem sido intensificada desde o 11 de setembro, e especialmente desde os ataques terroristas em Madrid (2004), Londres (2005) e Paris (janeiro e novembro de 2015). Na sequência das propostas apresentadas pela Presidência da UE e pelo coordenador da luta contra o terrorismo, o Conselho aprovou a Estratégia Europeia de Luta Contra o Terrorismo, que empenha a União no combate global ao terrorismo, respeitando embora os direitos humanos e dando aos seus cidadãos a possibilidade de viverem numa área de liberdade, segurança e justiça. Esta Estratégia abrange quatro vertentes de trabalho: Prevenção, Proteção, Perseguição e Reação.
O mandato de Gijs de Vries terminou em março de 2007, tendo sido substituído por Gilles de Kerchove (nacionalidade belga), em setembro de 2007, Professor de Direito em várias universidades belgas e antigo Diretor para a área JAI, no âmbito do Secretariado-Geral do Conselho.